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    物种数据库帮您更快发表高分文章!

    百迈客物种数据库是一个将多组学数据高度整合、集成在一起,实现数据的浏览、查询、再度挖掘的综合性平台。

    为了更好的服务于科研,物种数据库推出了V2.0版:不但可共享研究成果,而且通过后台管理系统可以完成logo、文字描述、配色、单位等信息的修改,更重要的是可以实现新增数据的一键式部署。

    更更重要的是,数据库也可以发表高分文章哦!

    百迈客物种数据库核心功能介绍

    标准版数据库:http://bio-db-demo.biocloud.net/home

    • Browse

    标准版Browse模块中共部署了7个子模块进行核心数据的浏览,如Browse中的Annotation模块,链接:http://tomato.biocloud.net/page/browse/Annotation

    功能说明:

    • 选择物种
    • 选择所关心的注释数据库类型(默认是All)
    • 输入所关心的基因ID或者功能注释关键字

    • Search

    标准版Search模块中共部署了5个子模块完成数据的查询、检索,如Search模块中的Multicriteria Search,

    链接:http://bio-db-demo.biocloud.net/page/search/multicriteriaSearch

    功能说明:

    • 选择待检索的变异类型,SNP ?或者 Indel
    • 选择在哪个版本的参考基因组中检索结果
    • 输入检索的染色体区域
    • 输入要检索的基因ID
    • 输入要检索的变异ID

    注 3、4、5三个选项只能选择一个哦!

    • 选择要在哪个品种中进行检索
    • 具体要检索的Type类型
    • 具体要检索的基因型Genotype

    点击Search后,即可完成特定样品在特定条件下的变异详情信息了,结果中还包括了变异位点上下游20bp、及500bp的序列信息,便于用户进行引物设计。

    • Tools

    标准版Tools模块中共部署了8款工具用于对库中多组学数据的进一步深度挖掘:

    如Tools模块中的Expression Visualization,

    链接:http://bio-db-demo.biocloud.net/page/tools/expressionVisualization

    功能说明:

    • 输入关心的基因ID,基因ID之前以逗号分隔
    • 选择特定个体、特定组织在特定处理条件下的样品

    点击“Display Expression Heatmap”即可构建出表达量热图

    • 后台管理

    通过管理员账号登录后台后,不但可以编辑背景色、?#26893;?#22270;、各个模块的文字描述,而且底层数据也可以通过后台进行上传、管理。

    再也不需要占用一个被?#39029;?#33853;满的硬盘存储科研数据了;

    再也不需要配备专业的美工去完成页面背景色的修改了;

    再也不需要哀求专业的IT开发工程师、运维工程师去完成底层数据的更新了(替换、追加随您便);

    背景色的编辑:

    Home页内容编辑:

    我们通过上面4部分内容,对百迈客物种数据库的功能做了一个简单的介绍。

    如果想了解更多的功能,

    如果想了解更多的后台管理功能

    如果您想为您的科研数据部署一个数据库

    请通过网站查看–http://bio-db-demo.biocloud.net/home

     

    成功案例:

    虾数据库:http://shrimp.biocloud.net

    番茄数据库:http://tomato.biocloud.net

    橡胶树数据库

    包括4份草图基因组、遗传变异数据、转录数据、表型数据等多组学数据信息,为科学家进一步研究提供帮助。

    点击访问
    柑橘数据库

    包含246个样本的Snp/Indel变异结果及性状数据,并且部署了CitEVOL等分析工具,用于进行PCA、进化树构建等分析。

    点击访问

     

     

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